科学関連リソース

概説

下記は、お客様の実験の計画と実行を支援する多数のウェブデータベースとリソースの一覧です。これには、抗体リソース、プロテオミクスのツール、疾患および変異のデータベース、その他シグナル伝達関連研究に有用なツールを提供するウェブサイトが含まれています。

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シグナル伝達の研究

Scansite scansite.mit.edu: タンパク質内のリン酸化部位と特定のドメイン結合領域を推測するスキャンサイト (MIT)。
NetPhos 2.0サーバー www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos: 真核生物タンパク質におけるリン酸化部位の神経ネットワーク予測 (デンマーク工業大学)。
Kinase.com www.kinase.com: ヒト、酵母、線虫、ハエのプロテインキナーゼの解析。
AAAS | ScienceのSTKE stke.sciencemag.org: シグナル伝達知識環境：シグナル伝達におけるリソースと情報 (Science誌、スタンフォード大学)。要購読。
BioCarta - Charting Pathways of Life www.biocarta.com/search/index.asp: シグナル伝達経路を選択し、模式図を閲覧できるオープンリソース。
Cell Cycle Regulated Yeast Genes genome-www.stanford.edu/cellcycle: 細胞周期によってmRNAレベルが制御される酵母遺伝子の同定 (スタンフォード大学)。
Horst Ibelgaufts’ COPE: Cytokines & Cells Online Pathfinder Encyclopedia www.copewithcytokines.org: サイトカインと細胞の百科事典 (ミュンヘン大学)。
GPCRDB: Information system for G protein-coupled receptors (GPCRs) https://gpcrdb.org: Gタンパク質共役型受容体の情報システム。
NetOGlyc 3.1 Server www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc: 哺乳類タンパク質のGalNAc O-glycosylation部位の予測 (デンマーク工業大学)。
SenseLab senselab.med.yale.edu: ニューロンと神経系の統合された他分野モデルを構築するための共同研究 (エール大学)。
Bioinformatics & Biological Computing bip.weizmann.ac.il: 一般的な疾患において極めて重要な役割を果たす可能性のある「注目の分子」の広範なアノテーション (Weizmann研究所)。

オンラインリンクへのゲートウェイ

San Diego Supercomputer Center: Delivering Cyberinfrastructure www.sdsc.edu: 分子生物学とプロテオミクスのためのツールとリソースの優れた抄録 (カリフォルニア大学サンディエゴ校)。
Cell and Molecular Biology Online www.cellbio.com: 細胞生物学、分子生物学に関する情報リソース。
TIGEM Telethon Institute of Genetics and Medicine www.tigem.it: EST (expressed sequence tags) 解析のためのリソースリンク (ブレシア大学)。

オンライン出版物と文献のサーチエンジン

Entrez PubMed www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed: 米国国立医学図書館 (NLM) が作成する、医学・薬学等の文献データベースMEDLINEの、無料検索エンジン。オンライン雑誌や、その他関連データベースへもリンクされています。
PubCrawler Web Service pubcrawler.gen.tcd.ie/: NCBI、Medline、GenBankデータベースの毎日の更新をスキャンする無料の「お知らせ」サービス。
Public Library of Science www.plos.org: 世界の科学・医学文献を科学者達や世界中の人々が自由にアクセスできるように公開する取り組み。

疾患と変異に関するデータベース

KinMutBase bioinf.uta.fi/KinMutBase: チロシンキナーゼドメインにおける疾患性変異のデータベース、他の変異データベースへのリンク付き (タンペレ大学)。
Atlas Chromosomes in Cancer atlasgeneticsoncology.org: がんとがん性疾患の生物学的および分子学的側面に着目した、腫瘍学と血液学における遺伝学的および細胞遺伝学的図譜。
OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM: ヒトのオンラインメンデル遺伝：ヒト遺伝子と遺伝性疾患の目録 (N.I.H.)。
The Human Gene Mutation Database (HGMD) www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php: ヒト遺伝子変異データベース (カーディフ大学臨床遺伝学研究所)
OMIM Locus-specific mutation database links www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/allresources.html#LocusSpecific: 数多くの遺伝子座特異的変異データベースへのリンク (N.I.H.)。
Disease Genes www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/: ポジショナルクローニングされたヒト疾患遺伝子 (N.I.H.)。
CGAP Collaboration www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap: がんゲノムの詳細な分析プロジェクト：がんに関与する遺伝子のデータベース (N.I.H.)。

ノックアウトマウスとトランスジェニックマウス

JAX Mice Database jaxmice.jax.org/query/: 遺伝子導入、または標的変異や化学処理による変異導入をしたマウス系統のソース (The Jackson Laboratory)。

ゲノムデータベース

TIGR Human Gene Index compbio.dfci.harvard.edu/tgi/: TIGRヒト遺伝子の索引。
Mitomap www.mitomap.org: ヒトミトコンドリアゲノム (エモリー大学)。
MGI 3.3 - Mouse Genome Informatics www.informatics.jax.org: マウスゲノム (ジャクソン研究所)。
Berkeley Drosophila Genome Project www.fruitfly.org: Drosophilaゲノムプロジェクト (カリフォルニア大学バークレー校)。
The Sanger Institute: C. elegans Project www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans: C. Elegansゲノム (サンガ―センター)。
Saccharomyces Genome Database www.yeastgenome.org: S. Cerevisiaeゲノム (スタンフォード大学)。