Revision 1

#39013Store at -20C

Cell Signaling Technology

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Web: [email protected] cellsignal.com

3 Trask LaneDanversMassachusetts01923USA
For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.
Applications:

WB, IP

REACTIVITY:

H Mk

SENSITIVITY:

Endogenous

MW (kDa):

44

SOURCE:

Rabbit

UniProt ID:

#Q13686

Entrez-Gene Id:

8846

Product Information

Product Usage Information

Application Dilution
Western Blotting 1:1000
Immunoprecipitation 1:200

Storage

Supplied in 10 mM sodium HEPES (pH 7.5), 150 mM NaCl, 100 µg/ml BSA and 50% glycerol. Store at –20°C. Do not aliquot the antibody.

Specificity / Sensitivity

ALKBH1 Antibody recognizes endogenous levels of total ALKBH1 protein.

Species Reactivity:

Human, Monkey

Source / Purification

Polyclonal antibodies are produced by immunizing animals with a synthetic peptide corresponding to residues near the carboxy terminus of human ALKBH1 protein. Antibodies are purified by peptide affinity chromatography.

Background

AlkB is an oxidative dealkylating DNA repair enzyme first characterized in E.coli (1-5). Nine AlkB homologs exist in mammals, with the first eight designated as ALKBH1-ALKBH8, and the ninth as FTO (fat mass and obesity-associated protein) (6). ALKBH1, which features the highest sequence identity to E.coli AlkB, is an Fe(II) and 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase that acts upon nucleic acids such as DNA and tRNA and carries out a wide range of enzymatic functions (6,7). Similar to other AlkB proteins, ALKBH1 is able to repair alkylated single-stranded DNA and RNA containing 3-methylcytosine (m3C), albeit with weak activity (8). Perhaps more importantly, it has also been shown to catalyze the demethylation of N1-methyladenosine on tRNAs to regulate translation (9). ALKBH1 functions in the mitochondria as well, recognizing and oxidizing 5-methylcytosine (m5C) on mitochondrial tRNAMet to generate 5-formylcytosine, consequently enhancing mitochondrial translation (10). Interestingly, ALKBH1 has also been shown to possess apurinic/apyrimidinic (AP) lyase activity, cleaving both single-stranded and double-stranded DNA at abasic sites, with greatest affinity toward double-stranded DNA with two abasic sites (11). Lastly, ALKBH1 has been reported to possess N(6)-methyladenine (6mA) demethylase activity, suggesting a role in epigenetic regulation (12,13). However, an additional study was unable to show definitive ALKBH1 6mA demethylase activity using both biochemistry assays and knockout mice, so this enzymatic function remains controversial (9).

  1. Samson, L. and Cairns, J. (1977) Nature 267, 281-3.
  2. Chen, B.J. et al. (1994) J Bacteriol 176, 6255-61.
  3. Aravind, L. and Koonin, E.V. (2001) Genome Biol 2, RESEARCH0007.
  4. Trewick, S.C. et al. (2002) Nature 419, 174-8.
  5. Falnes, P.Ø. et al. (2002) Nature 419, 178-82.
  6. Fedeles, B.I. et al. (2015) J Biol Chem 290, 20734-42.
  7. Müller, T.A. et al. (2018) Biochem Biophys Res Commun 495, 98-103.
  8. Westbye, M.P. et al. (2008) J Biol Chem 283, 25046-56.
  9. Liu, F. et al. (2016) Cell 167, 816-828.e16.
  10. Haag, S. et al. (2016) EMBO J 35, 2104-19.
  11. Müller, T.A. et al. (2010) DNA Repair (Amst) 9, 58-65.
  12. Xiao, C.L. et al. (2018) Mol Cell 71, 306-318.e7.
  13. Wu, T.P. et al. (2016) Nature 532, 329-33.

Species Reactivity

Species reactivity is determined by testing in at least one approved application (e.g., western blot).

Western Blot Buffer

IMPORTANT: For western blots, incubate membrane with diluted primary antibody in 5% w/v BSA, 1X TBS, 0.1% Tween® 20 at 4°C with gentle shaking, overnight.

Applications Key

WB: Western Blotting IP: Immunoprecipitation

Cross-Reactivity Key

H: human M: mouse R: rat Hm: hamster Mk: monkey Vir: virus Mi: mink C: chicken Dm: D. melanogaster X: Xenopus Z: zebrafish B: bovine Dg: dog Pg: pig Sc: S. cerevisiae Ce: C. elegans Hr: horse GP: Guinea Pig Rab: rabbit All: all species expected

Trademarks and Patents

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Revision 1
#39013

ALKBH1 Antibody

Western Blotting Image 1: ALKBH1 Antibody Expand Image
Western blot analysis of extracts from 293T and K-562 cells using ALKBH1 Antibody.
Immunoprecipitation Image 1: ALKBH1 Antibody Expand Image
Immunoprecipitation of ALKBH1 from 293T cell extracts. Lane 1 is 10% input, lane 2 is Normal Rabbit IgG #2729, and lane 3 is ALKBH1 Antibody. Western blot analysis was performed using ALKBH1 Antibody. Mouse Anti-rabbit IgG (Conformation Specific) (L27A9) mAb (HRP Conjugate) #5127 was used as a secondary antibody.