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PTMScan® Discoveryサービスで使用するモチーフ抗体

Cell Signaling Technologyは、細胞機能を制御する翻訳後修飾 (PTM) にフォーカスした解析に用いるモチーフ抗体を開発しました。CSTはこれらの抗体を、PTMScanライセンスと、PTMScan Discoveryサービスおよび、IAPビーズを組み合わせた製品として使用しています。これらの製品について、使用毎にライセンス提供することで、お客様はご自身でPTMScanプロテオミクス解析を行うことができます。

CSTは、PTMScan DiscoveryサービスとPTMScanライセンス/IAPビーズ製品により、細胞機能を制御するPTMの詳細なプロテオミクス解析のためのパワフルなツールを提供します。特定のセリン/スレオニンキナーゼファミリーまたはキノームブランチ、チロシンリン酸化の全容、タンパク質のアセチル化、またはユビキチン媒介型シグナル伝達など、お客様の多様な研究目的に対応します。

PTMScan – PhosphoScan®、UbiScan®、AcetylScan® – はPTMプロテオミクスのための最も効率的な戦略です。また、CSTのPTMScanライセンス/IAPビーズ製品 (以下参照) は、イムのアフィニティ精製 (IAP) による、セリン/スレオニンおよびチロシンのリン酸化ペプチド、アセチル化ペプチド、ユビキチン化ペプチドの濃縮に最適化された試薬です。PTMScanはモチーフ抗体ベースのIAPとタンデム質量分析を組み合わせた手法で、細胞機能を制御する重要なタンパク質と、そのPTM​の定量的な解析を行うことができます。CSTのモチーフ抗体はPTMに対して特異的であるため、PTMScan Discoveryサービスおよび、使用毎にライセンシングされるPTMScanライセンス/IAPビーズ製品が、制御性シグナル伝達のプロテオミクス解析におけるスタンダードになっています。

下表に記載されている各モチーフ抗体については、LC-MS/MSデータファイル (RAWファイル) が提供されています。LC-MS/MSデータファイルはThermo Orbitrap (VelosまたはElite) を用いて作成しました。結果の表 (エクセル形式) には、マウス肝臓ペプチドを対応するモチーフ抗体で濃縮した各RAWデータファイルが添付されています。添付エクセル表のペプチド/タンパク質の割り当ては、SEQUESTを用いて検索しました。各データセットのサンプル詳細は、結果表のヘッダーにあります。

説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Phospho-Akt Substrate 9614 5561 RXX(S*/T*) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-Akt Substrate 10001 5563 RXRXX(S*/T*) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-(Ser/Thr) AMPK Substrate 5759 5564 (L/M)XRXX(S*/T*), RXX(S*/T*) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-(Ser) ATM/ATR Substrate 9607 12267 S*Q マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
Phospho-(Ser/Thr) ATM/ATR Substrate 6966 12267 (S*/T*)QG, (S*/T*)Q マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
Phospho-(Ser) CDKs Substrate 9477   (K/H)S*P  
Phospho-(Ser/Thr) CK II Substrate 8738 12170 (S*/T*)DXE マウス肝臓  |  PDF
Phospho-MAPK/CDK Substrates 2325 4652 PXS*P, S*PX(K/R) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-(Ser/Thr) PDK1 Docking Motif 9634   (F/K)XX(F/Y)(S*/T*)(F/Y) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
Phospho-PKA Substrate 9624 5565 (K/R)(K/R)X(S*/T*) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-(Ser) PKC Substrate 6967   (K/R)XS*X(K/R) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
Phospho-(Thr) PLK Binding Motif 5243 5566 ST*P マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-Thr-Pro Motif 3003   T*P, T*PP マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
Phospho-Thr-Pro-Glu Motif 3004   T*PE, T*P マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-Thr-X-Arg Motif 2351   T*X(K/R) マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Phospho-Tyrosine (P-Tyr-100) 9411 5636 Y* マウス脳  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Phospho-Tyrosine (P-Tyr-1000) 8954 8803 Y* マウス脳  |  XLS  |  RAW
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Acetylated-Lysine 9814 13416 Ac-K マウス肝臓  |  XLS  |  RAW
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Cleaved Caspase Substrate 8698 12810 DE(T/S/A)D  
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Mono-Methylated-Arginine 8015, 8711 12235 Me-RおよびMe-RGG マウス胚  |  XLS  |  RAW  |  PDF
Di-Methyl Arginine 13522 13474 [R]  
Di-Methyl Arginine 13222 13563 [RG]  
説明 抗体 Kit コンセンサス部位 LCMSデータ​&アウトプット結果
Ubiquitin Branch 3925 5562 K-ε-GG マウス肝臓  |  XLS  |  RAW  |  PDF