混合形質型白血病は、パートナータンパク質と融合タンパク質を形成するMLL (Mixed Lineage Leukemia) 遺伝子の染色体転座によって特徴づけられます。これらのMLL融合パートナーの多くは、転写伸長の調節に関与する転写伸長因子複合体の構成因子です。MLL融合タンパク質は、発がん遺伝子やがん抑制遺伝子の異常な転写調節を引き起こして発がんを開始する、発がん性転写因子を形成します。
MLL1は2つのポリペプチドにプロセシングされますが、両方とも野生型MLL複合体のサブユニットです。MLL1のN末端側は、白血病誘発を起こす融合タンパク質に含まれています。野生型MLL1の検出にはC末端特異的な抗体、MLL融合タンパク質の検出にはN末端特異的な抗体の使用を推奨します。
DOT1Lは、転写伸長因子複合体のMLL転座パートナーと相互作用し、MLLによる白血病誘発に必要です。DOT1Lは、ヒストンH3のLys79のメチル化を通じて遺伝子発現を促進すると考えられています。
p300とCBPは、ヒストンのアセチル化を介して遺伝子発現を促進する、付加的なMLL融合タンパク質です。
ChIP/ChIP-seqによって検出されるこれらマークのレベルの変化は、MLL1、DOT1L、およびCBP/p300の標的遺伝子への結合の変化を示していることがあります。