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概説
下記は、お客様の実験の計画と実行を支援する多数のウェブデータベースとリソースの一覧です。これには、抗体リソース、プロテオミクスのツール、疾患および変異のデータベース、その他シグナル伝達関連研究に有用なツールを提供するウェブサイトが含まれています。
詳細を表示する
シグナル伝達の研究
Scansite
scansite.mit.edu
タンパク質内のリン酸化部位と特定のドメイン結合領域を推測するスキャンサイト (MIT)。
NetPhos 2.0サーバー
www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos
真核生物タンパク質におけるリン酸化部位の神経ネットワーク予測 (デンマーク工業大学)。
Kinase.com
www.kinase.com
ヒト、酵母、線虫、ハエのプロテインキナーゼの解析。
AAAS | ScienceのSTKE
stke.sciencemag.org
シグナル伝達知識環境:シグナル伝達におけるリソースと情報 (Science誌、スタンフォード大学)。要購読。
BioCarta - Charting Pathways of Life
www.biocarta.com/search/index.asp
シグナル伝達経路を選択し、模式図を閲覧できるオープンリソース。
Cell Cycle Regulated Yeast Genes
genome-www.stanford.edu/cellcycle
細胞周期によってmRNAレベルが制御される酵母遺伝子の同定 (スタンフォード大学)。
Horst Ibelgaufts’ COPE: Cytokines & Cells Online Pathfinder Encyclopedia
www.copewithcytokines.org
サイトカインと細胞の百科事典 (ミュンヘン大学)。
GPCRDB: Information system for G protein-coupled receptors (GPCRs)
https://gpcrdb.org
Gタンパク質共役型受容体の情報システム。
NetOGlyc 3.1 Server
www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc
哺乳類タンパク質のGalNAc O-glycosylation部位の予測 (デンマーク工業大学)。
SenseLab
senselab.med.yale.edu
ニューロンと神経系の統合された他分野モデルを構築するための共同研究 (エール大学)。
Bioinformatics & Biological Computing
bip.weizmann.ac.il
一般的な疾患において極めて重要な役割を果たす可能性のある「注目の分子」の広範なアノテーション (Weizmann研究所)。
オンラインリンクへのゲートウェイ
San Diego Supercomputer Center: Delivering Cyberinfrastructure
www.sdsc.edu
分子生物学とプロテオミクスのためのツールとリソースの優れた抄録 (カリフォルニア大学サンディエゴ校)。
Cell and Molecular Biology Online
www.cellbio.com
細胞生物学、分子生物学に関する情報リソース。
TIGEM Telethon Institute of Genetics and Medicine
www.tigem.it
EST (expressed sequence tags) 解析のためのリソースリンク (ブレシア大学)。
オンライン出版物と文献のサーチエンジン
Entrez PubMed
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
米国国立医学図書館 (NLM) が作成する、医学・薬学等の文献データベースMEDLINEの、無料検索エンジン。オンライン雑誌や、その他関連データベースへもリンクされています。
PubCrawler Web Service
pubcrawler.gen.tcd.ie/
NCBI、Medline、GenBankデータベースの毎日の更新をスキャンする無料の「お知らせ」サービス。
Public Library of Science
www.plos.org
世界の科学・医学文献を科学者達や世界中の人々が自由にアクセスできるように公開する取り組み。
疾患と変異に関するデータベース
KinMutBase
bioinf.uta.fi/KinMutBase
チロシンキナーゼドメインにおける疾患性変異のデータベース、他の変異データベースへのリンク付き (タンペレ大学)。
Atlas Chromosomes in Cancer
atlasgeneticsoncology.org
がんとがん性疾患の生物学的および分子学的側面に着目した、腫瘍学と血液学における遺伝学的および細胞遺伝学的図譜。
OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man
www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM
ヒトのオンラインメンデル遺伝:ヒト遺伝子と遺伝性疾患の目録 (N.I.H.)。
The Human Gene Mutation Database (HGMD)
www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php
ヒト遺伝子変異データベース (カーディフ大学 臨床遺伝学研究所)
OMIM Locus-specific mutation database links
www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/allresources.html#LocusSpecific
数多くの遺伝子座特異的変異データベースへのリンク (N.I.H.)。
Disease Genes
www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/
ポジショナルクローニングされたヒト疾患遺伝子 (N.I.H.)。
CGAP Collaboration
www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap
がんゲノムの詳細な分析プロジェクト:がんに関与する遺伝子のデータベース (N.I.H.)。
ノックアウトマウスとトランスジェニックマウス
JAX Mice Database
jaxmice.jax.org/query/
遺伝子導入、または標的変異や化学処理による変異導入をしたマウス系統のソース (The Jackson Laboratory)。
ゲノムデータベース
TIGR Human Gene Index
compbio.dfci.harvard.edu/tgi/
TIGRヒト遺伝子の索引。
Mitomap
www.mitomap.org
ヒトミトコンドリアゲノム (エモリー大学)。
MGI 3.3 - Mouse Genome Informatics
www.informatics.jax.org
マウスゲノム (ジャクソン研究所)。
Berkeley Drosophila Genome Project
www.fruitfly.org
Drosophila
ゲノムプロジェクト (カリフォルニア大学バークレー校)。
The Sanger Institute: C. elegans Project
www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans
C. Elegans
ゲノム (サンガ―センター)。
Saccharomyces Genome Database
www.yeastgenome.org
S. Cerevisiae
ゲノム (スタンフォード大学)。
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