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GRAMタンパク質ドメイン

リン脂質結合:GRAMドメイン

MTMR2GRAMドメイン

ドメイン結合および機能

GRAM (Glucosyltransferases, Rab-like GTPase activators and Myotubularins) ドメインは、約70アミノ酸残基から成り、7本鎖βサンドイッチとC末端のαヘリックスを形成します。GRAMドメインはMyotubularinファミリーのホスファターゼに共通して見られ、およそ180種類のタンパク質に存在すると考えられています。MTMR2 (myotubularin related protein 2) のGRAMドメインは、PH (pleckstrin homology) ドメインに見られるような、予想できないほど大きな折り畳み構造を示します。GRAMドメインを持つタンパク質は、大半が膜に関係するプロセスに関与しています。機能解析の研究から、GRAMドメインが、PI-(3、5)P2基質の認識、PI-(3)-P/PI-(5)-P依存型オリゴマー形成、およびMyotubularinホスファターゼのPI-(5)-P特異的アロステリック活性化に関与することが立証されています。GRAMドメインの構造を障害する遺伝子変異は、X連鎖先天性ミオパチーなどのヒト疾患に繋がる可能性があります。

構造

MTMR2GRAM配列は、構造的にPHドメインの折り畳み構造をとる、より大きなモチーフの一部をなす5本鎖βストランドを形成します。GRAMドメインは、すぐ近傍のアミノ酸残基と共に、C末端にαヘリックスを持つ7本鎖βサンドイッチ構造から成る三次構造を形成します。MTMR2GRAMドメインの構造は、PleckstrinのPHドメインに非常によく似ています。すなわち、GRAMのコアとなるドメイン中に高度に保存されたアミノ酸残基があり、他のGRAMドメインは、類似したPHドメインの折り畳み構造を共有していると考えられます。

構造の参考文献

  1. Begley, M.J., et al. (2003) Mol. Cell 12(6), 1391–1402.

ドメインタンパク質の例

リン脂質結合:GRAMドメイン

結合の例

GRAMドメインタンパク質 特異的ホスホイノシチドリガンド
MTMR2 PI-(3,5)-P2, PI-(5)-P
MTM1, MTMR3, and MTMR6 PI-(5)-P