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PTBタンパク質ドメイン

リン酸/チロシン結合:PTBドメイン

TrkAリン酸化ペプチド () に結合したShcのPTBドメイン

ドメイン結合および機能

PTB (Phosphotyrosine binding) ドメインは、100–150アミノ酸残基のモジュールで、共通してAsn-Pro-X-Tyrモチーフに結合します。ドッキングタンパク質ShcおよびIRS-1のPTBドメインは、チロシン残基がリン酸化されたリガンド (NPXpY) を認識して結合します。また、高い親和性と特異性獲得のためには、これに加えてN末端配列が必要になります。このペプチドは逆平行のβシートに対してβストランドとして結合しますが、一方、NPXpYモチーフは塩基性アミノ酸残基によって認識されるためにpY位置で折り返します。X11、Dab、Fe65、Numbなどのタンパク質のPTBドメインは、NPXYや関連ペプチドモチーフを明確に認識しますが、リガンドのリン酸化には依存しません。さらに、NumbのPTBドメインは、ヘリックス状のターンを形成する無関係のペプチドに結合することができます。

構造の参考文献

  1. Zhou, M.M. et al. (1995) Nature 378(6557), 584–592.

ドメインタンパク質の例

リン酸/チロシン結合:PTBドメイン

結合の例

PTBドメインタンパク質 結合パートナー&ペプチドリガンド
Shcドッキングタンパク質 TrkA神経成長因子受容体:Ile-Ile-Glu-Asn-Pro-Gln-pTyr
PIRS-1ドッキングタンパク質 インスリン受容体:Leu-Tyr-Ala-Ser-Ser-Asn-Pro-Glu-pTyr
X11神経細胞タンパク質 βアミロイド前駆体タンパク質:Tyr-Glu-Asn-Pro-Thr-Tyr
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