PTMScan® Pathway Based Enrichmentキット
的を絞ったアプローチで、創薬標的やバイオマーカーの発見をお手伝いします
PTMScan® Pathway Based Enrichmentキットは、質量分析ベースのスクリーニングおよび定量化によるPTM解析を行うことで、重要なシグナル伝達経路の制御に関与する数千のタンパク質部位を解析することができます。これらのキットには、PTMScan® Directサービスで使用されているものと同じ抗体と技術が含まれています。標準的な部位特異的抗体を固定化したマルチプレックスビーズを利用して、既知の経路にて選定された標的のPTMを解析します。
解析の対象範囲には、創薬、バイオマーカーの探索、診断法の開発に重要な、主要なシグナル伝達ノードのリン酸化タンパク質および総タンパク質の部位が含まれます。このアプローチは、重要なデータポイントの見落としの可能性を下げることにより、網羅的な解析が可能で、カスタマイズ可能な柔軟性があり、標的を絞った後のフォローアップ解析もできます。
Multi-Pathway Enrichmentキット
ヒトがん細胞株をPTMScan® Multi-Pathway Enrichmentキットによって解析し、ペプチドをLC-MS/MSで同定しました。図は、解析結果から作成したタンパク質の相対カテゴリー分布です。
パスウェイの対象範囲
PTMScan® Multi-Pathway Enrichmentキットを用いることで、1度の実験で4000以上のユニークな部位および 800以上の重要な機能既知のタンパク質をプロファイリングでき、キーファクターの同定や定量が可能です。
ハイライトされた紫色のノードは、PTMScan® Multi-Pathway Enrichmentキットでモニタリング可能な、シグナル伝達経路内の標的タンパク質の修飾部位を表します。
解析結果の階層クラスタリング
PTMScan® Multi-Pathway Enrichmentキットを用いた解析で得られた、濃縮ペプチドの相対量に基づく階層クラスタリング。左：各段は組織のタイプに対するユニークなペプチドの結果。右：同定および定量されたAktペプチドの詳細。データは、0 (白、最低存在量) から1 (青、最高存在量) のスケールで示されています。
ギャップを橋渡しする
PTMScan® Multi-Pathway Enrichmentキットは、様々な細胞株、様々な実験処理におけるシグナル伝達経路の解析に適用可能な柔軟性をもち、フォローアップ実験のカスタマイズも容易です。例えば、まずはサンプル数を少数に絞って解析し、大量に見られる標的や、機能的な関連性が高いと考えられる標的に解析対象を絞り込みます。その後、解析サンプル数を増やし、先のステップで絞り込んだ標的に注目して解析を進めます。この解析には、引き続き、同じキットを使用することができます。PTMScan®の結果は、AQUA合成ペプチドあるいはその他の標準ペプチドを用いて検証することができます。
すべてのPTMScan®キットは、アッセイ10回分の試薬と詳細なプロトコールが含まれます。キットの内容には、PTMScan®技術の限定使用ライセンスも含まれます。