ソニケーション処理は、ChIPのクロマチン調製によく用いられる方法です。しかしながら、ほとんどのプロトコールでは、クロマチンを過酷な変性条件 (高熱、界面活性剤、せん断など) にさらす必要があり、抗体エピトープとクロマチンの完全性が損なわれてしまう恐れがあります。
CSTは、従来のソニケーション処理プロトコールの問題を避けるために、複数のオプションを提供します:
ソニケーションまたは酵素消化のSimpleChIPキットは、ヒストンの解析では従来のソニケーションと同様に機能し、転写因子や転写コファクターの解析では従来のソニケーションよりも優れています。
クロマチンをクロスリンクし、Micrococcal Nuclease (CSTの酵素消化:青)、CSTのソニケーションバッファー (赤)、または従来のソニケーションバッファー (緑色) で断片化し、記載された抗体を用いて免疫沈降しました。DNAは、SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005のプロトコールに従って調製し、シーケンシングに使用しました。
No. | 製品名 | アプリケーション | サンプル (細胞/組織) |
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#56383 | SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |
#9005 | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |
#9003 | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) | ChIP、ChIP-seq | 細胞 |
#9004 | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) | ChIP | 細胞と組織 |
#9002 | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) | ChIP | 細胞 |
#81804 | SimpleChIP® Sonication Cell and Nuclear Lysis Buffers | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |
#14282 | SimpleChIP® Enzymatic Cell Lysis Buffers A & B | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |
#14231 | SimpleChIP® Chromatin IP Buffers | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |
#14209 | SimpleChIP® DNA Purification Buffers and Spin Columns | ChIP、ChIP-seq | 細胞と組織 |