SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kitが市販されているキットと比較して、同程度またはより高い性能を発揮することを確認するために、市場をリードする2つのキットと比較しました。それぞれのキットに提供されているプロトコールで得られたデータから、SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kitが以下のようであることが明らかとなりました。
各キットの製造者から提供されたプロトコールに従い、4 x 106個のHCT 116細胞をクロスリンクしたクロマチンからクロマチンサンプルを調製し、記載された抗体を用いて免疫沈降を行いました。図左側のChIP-seqの結果からは、興味のある局在領域の全体にわたって、標的タンパク質が濃縮されていることが示されています。図右側のメタゲノム解析では、ゲノム全体において確認されたピークのS/N比が示されています。インプットサンプルは、ChIP-seqのトラッキングおよびメタゲノム解析の両方において、ネガティブコントロールとして使用されました。